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こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。
> 今までこの「hinshi_mecab」のファイルは幾度か弄ってみたのですが、その
> 度抽出語数の「（使用）」はまったく変わりませんでしたので、妙に思って
> います。
これは確かに妙ですね。
試しに、hinshi_mecabの内容をhinshi_chasenとまったく同じにした上で、前
処理を実行してみますと、抽出語数や抽出語リストは変化しますでしょうか？
もしも変化しないとすると、hinshi_mecabの設定が読み込まれていないような
感じがします。
この場合は、正しいhinshi_mecabを修正しているのか、他にもhinshi_mecabが
存在するのではないかという疑問が生じます。
c:\khcoder\config\hinshi_mecabを編集されているということですが、もしか
して、c:\khcoder以外の場所にもKH Coderが存在するといったことは無いでし
ょうか？
ショートカットからKH Coderを起動されている場合、ショートカット上で右ク
リックして「プロパティ」を選択し、「リンク先」をチェックしてみてくださ
い。「リンク先」はc:\khcoder\kh_coder.exeになっていますでしょうか？
あるいは「config」フォルダ中に「hinshi_mecab」だけでなく
「hinshi_mecab.txt」といったファイルが存在し、内容が編集されているのは
後者のみといったことは、ございますでしょうか。