こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。
> Non-function objects are not currently inserted (not traceable): .packageName
> Modified functions inserted through trace(): wordlayout
このあたりは、各行の前半をGoogle検索してみると、何か手がかりが出てこな
いでしょうか。
> [1] "iterations: 500010"
こちらは「iterations」で、KH Coderから保存した*.rファイルを検索してみ
るといかがでしょう。画面に出るということは「print」コマンドを使ってい
る可能性が高いわけですが、何をprintしているのか調べてみるといかがで
しょう。