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こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。
> 「（分析対象の）ファイル名＿ch.txt」
茶筌による形態素解析（語の取り出し）結果が入っているファイルです。
> 「（分析対象の）ファイル名＿mph.txt」
分析対象ファイルを、茶筌に投入できるように微修正したファイルです。
いずれもテキストエディタ「mi」なら開いて中を確認できるはずです。
https://www.mimikaki.net/
なお、「coder_data」内のファイル群は自動的に生成されますが、
自動的に削除されることもあります。残しておく必要がある分析結果
等は、別の場所に、別名で保存しておいてください。