こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。「『文書×抽出語』表の出力」コマンドで、「集計単位」を「H1」に設定すると、H1ごとに集計した結果が出力されます。ただ、「抽出語リスト」とは違う形になりますので、「抽出語リスト」の形が必要であれば、別個のファイルに分ける必要があるでしょう。この場合は、文書の数にもよりますが、プラグインを使って自動化をすると便利かもしれません。自動化について詳しくはこちらの本をどうぞ:http://amzn.to/1w4Fe4Z