Re: 対応分析の座標出力についての質問 (加藤) KH Coder 旧掲示板
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  [No.3845] 対応分析の座標出力についての質問 投稿者:加藤  投稿日:2018/10/28(Sun) 18:49:07

樋口先生


投稿失礼いたします。
対応分析の座標の出力に関してお伺いしたくて
投稿させていただきました。

過去の投稿(2011年8月6日の投稿者:前田さんと先生のやり取り)を参考にして,
「R Source」形式で保存した対応分析の結果をRのコンソール画面にドラッグしました。
R上で,対応分析の結果が出たのですが,その際に,以下の文章が出てきました。


成分 固有値 寄与率
[1,] 1 0.0129 100
Need help getting started? Try the cookbook for R:
http://www.cookbook-r.com/Graphs/
要求されたパッケージ sp をロード中です
Checking rgeos availability: FALSE
Note: when rgeos is not available, polygon geometry computations in maptools depend on gpclib,
which has a restricted licence. It is disabled by default;
to enable gpclib, type gpclibPermit()
要求されたパッケージ Rcpp をロード中です
要求されたパッケージ RColorBrewer をロード中です
Non-function objects are not currently inserted (not traceable): .packageName
Modified functions inserted through trace(): wordlayout
[1] "iterations: 62"
警告メッセージ:
1: パッケージ ‘ggplot2’ はバージョン 3.1.3 の R の下で造られました
2: In grid.Call(L_textBounds, as.graphicsAnnot(x$label), x$x, x$y, :
Windows のフォントデータベースにフォントファミリが見付かりません
3: In grid.Call.graphics(L_text, as.graphicsAnnot(x$label), x$x, x$y, :
Windows のフォントデータベースにフォントファミリが見付かりません
>

この文章の意味が十分理解できないまま,過去の投稿にあった,
以下のコマンドを入力し,対応分析の入力の表を保存しようとしました。

#--------------------------------------------------------------------
savefile <- "C:\\temp0.csv"
out_data <- cbind(rownames(d), d)
if (nchar(savefile)) {
write.table(
out_data,
savefile,
sep=",",
quote=F,
row.names=F
)
print( paste("saved: ",savefile) )
}
#--------------------------------------------------------------------

その結果,以下の文章が出てきました。

> savefile <- "C:\\temp0.csv"
> out_data <- cbind(rownames(d), d)
> if (nchar(savefile)) {
+ write.table(
+ out_data,
+ savefile,
+ sep=",",
+ quote=F,
+ row.names=F
+ )
+ print( paste("saved: ",savefile) )
+ }
以下にエラー file(file, ifelse(append, "a", "w")) :
コネクションを開くことができません
追加情報: 警告メッセージ:
In file(file, ifelse(append, "a", "w")) :
ファイル 'C:\temp0.csv' を開くことができません: Permission denied
>

この一連の操作が,どこで間違っており,何が起こったのか
十分に把握できない状況です。


このような事態において,対応分析の結果の元となった表・座標を出すために,
どうすべきか教えてください。

ちなみに,khcoder-3a14b.exe (2018 10/21)を使用しておりまして,
自由記述の内容を男女比較したいと思っております。
しかし,コーディングのカテゴリーと性別で対応分析をしたため,
成分が一つしか算出されませんでしたので,
分析結果を,一次元,あるいは表で報告しようと考えております。


お忙しいところ恐縮ですが,どうぞよろしくお願い致します。


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