こんにちは、樋口です。
貴重なデータを拝見させていただき、誠にありがとうございます。
おかげさまで、KH Coderのバグを1つ発見できました。「使用しない語」の指
定によって、ある文書(段落)中に「使用する語」が1つも無くなった場合に、
当該のエラーが発生するというバグでした。
対策版をひとまずこちらにご用意しました。
http://khcoder.info/psnl/tmp/kh_coder.exe
現在お使いのkh_coder.exeに上書きしてお使い下さい。
なおバグフィックスが終わりましたので、お送りいただいたデータはすべて削
除させていただきました。