こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。KH Coderのメイン画面では、ケース数はいくつになっているでしょうか?メイン画面というのは、最初に出てくる画面で、上部に「プロジェクト」「前処理」「ツール」などのメニューがある画面です。「文書の単純集計:」の箇所で、「段落」の「ケース数」をみてください。本来は、ここで表示された数と、入力ファイルの行数、出力した「文書×抽出語」表の行数が一致するはずなのですが、一致状況はいかがでしょう?