こんにちは、樋口です。
書き込みありがとうございます。
数字が合わないのは、マニュアルに記載していなかったKH Coderの仕様のため
です。ご心配ならびにお手数をおかけして申し訳ありません。
KH Coder（が使用しているRのchisq.test関数）は、2行2列のクロス表からカ
イ二乗値を計算する際には、自動的にイェーツの補正（連続修正）を行います。
ここで言うクロス表とは、No. 873のスクリーンショットで例示しているよう
な、通常のクロス集計表のことです。
http://khcoder.info/cgi-bin/bbs_khn/khcf.cgi?no=873&reno=872&oya=872&mode=msgview
したがって「男性」「女性」のように2種類の値を持つ外部変数を用いる場合、
常に補正がかかります。
お使いの統計ソフトに、「イェーツの補正」ないしは「連続修正」といった出
力項目があれば、そちらとは一致するのではないかと思います。
