こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。
「edit_network1.r」や「edit_network2.r」のような添付ファイルの場所です
が、そういえばスライド内に書いていなくて、不親切でした。「tutorial_jp」
フォルダ内に、さらに「using_R」というフォルダがあり、その中に入ってお
ります。
その他のヒントについても、「tutorial_jp」内の他のフォルダを見ていただ
くと添付ファイルが入っています。
なお、Jaccard係数を表示する場合は、「edit_network2.r」をそのまま使用で
きないかなと思います。そのままでは、Jaccard係数の表示がなくなってしま
うと思います。対処法としては、「edit_network2.r」を秀丸やサクラエディ
タのようなテキストエディタで開き、「plot.igraph」の手前まで実行します。
実行というのは、コマンドをコピーして、Rのコンソールに貼り付けてエンタ
ー・キーを押すことです。その後、Jaccard係数を表示するためのコマンドを
実行すると良いでしょう。
蛇足ながら、Jaccard係数を表示すると、どうしても重なってしまう部分がで
てくるかもしれません。その場合には、Acrobat & Illustratorで画像ファイ
ルとしての編集を行い、数値の表示位置を手でずらしてやるのも一手でしょう。
(こうした編集をフリーソフトウェアで行えると良いのですが、まだ良いソフ
トに出会えていません)
http://khc.sourceforge.net/FAQ.html#illust