樋口先生、赤羽と申します。

ご教示をいただきたいことがございます。
どうぞ、よろしくお願いいたします。


作成描画した共起ネットワークをファイル保存する方法が色々とあります。（pdf、png、R、等）

共起ネットワークはグラフ（ネットワーク）ですので、
もし、汎用的なグラフファイル形式（graphml、gml、xgml等）で保存できれば、
再利用、活用の幅が広がると思っています。

もし、グラフファイル形式で保存できるやり方をご存知でしたら、
ご教示をいただけると大変に重宝します、勉強になります。

お手数をおかけいたしますが、どうぞ、よろしくお願いいたします。

こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。

グラフ形式での保存については、以前にもご要望をいただいたことがあり、将
来的には追加すべき機能として検討中です。graphml、gml、xgml等ですが、ど
の形式が一番広く普及しているか、どの形式に対応するのが一番便利そうかと
いった点について、もしお考えとのところがございましたらお教えいただけま
すと幸いです。

なお、少し情報が古くなっているかもしれませんが、Cytoscape、Gephi、
VOSviewer、Pajekといったソフトにデータを出力する方法をこちらにまとめて
います。
http://khcoder.info/cgi-bin/bbs_khn/khcf.cgi?no=577&mode=allread

樋口先生、赤羽と申します。

お世話になります。
早々に、ご教示をいただきまして誠にありがとうございます。

私は、graphml形式でグラフファイルを作成してグラフツールを利用しています。
graphml形式がよく利用されるような印象を持っています。


先生がお書きくださいました、ノードリスト、エッジリストを用いる方法があることは知りませんでした。
勉強になりました。

ありがとうございました。






> こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。
>
> グラフ形式での保存については、以前にもご要望をいただいたことがあり、将
> 来的には追加すべき機能として検討中です。graphml、gml、xgml等ですが、ど
> の形式が一番広く普及しているか、どの形式に対応するのが一番便利そうかと
> いった点について、もしお考えとのところがございましたらお教えいただけま
> すと幸いです。
>
> なお、少し情報が古くなっているかもしれませんが、Cytoscape、Gephi、
> VOSviewer、Pajekといったソフトにデータを出力する方法をこちらにまとめて
> います。
> http://khcoder.info/cgi-bin/bbs_khn/khcf.cgi?no=577&mode=allread