こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。
はい、残念ながらプロジェクト登録→前処理とやり直していただくのが
安全です。
ファイル名を変える前であれば、一度プロジェクトをエクスポートしてから
インポートするという方法があります。インポート時には、分析対象ファイ
ルの保存場所・名前を決めることができますので、任意の場所・名前に変更
できます。そして、インポート完了後に、エクスポート元のプロジェクトを
削除すればOKです。ただし、プロジェクトのインポート・エクスポートにも
それなりの時間がかかってしまうという問題がありますが、プロジェクトの
バックアップ・ファイル(*.khcファイル)作成を兼ねてと考えれば、それほ
ど悪くないかもしれません。
ファイル名変更後にどうしてもということであれば、「config」フォルダ内
の「project」ファイルを編集するという方法はあります。このファイルに、
各分析対象ファイルのファイル名が保存されています。文字コードはEUCです。
このファイル内の分析対象ファイル名を修正することで、一応分析を続けら
れるとは思います。ただ、この方法はなんらまったくテスト・検証していな
いので、あまりお勧めできません。
それでは、よろしくお願いいたします。