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  [No.851] クラスタリングエラー(推定または描画に失敗しました) 投稿者:アリ  投稿日:2011/10/03(Mon) 13:26:15

樋口先生、お世話になっております。アリです。

KHCoderを用いて、クラスタリングを実行するとき、次のエラーが発生しました。
<推定または描画に失敗しました。(cannot allocation vector size 1.1G)>

このエラーはメモリが足りないためVectorを作成できないということを考えられていますが。認識相違がありますか?
メモリ拡張以外、何か解決方法がありますか?
また、ちょっと量があるデータに対するどうやって分析できますか?

よろしくお願い致します。


  [No.852] Re: クラスタリングエラー(推定または描画に失敗しました) 投稿者:HIGUCHI Koichi  投稿日:2011/10/03(Mon) 14:43:56

こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。

> cannot allocation vector size 1.1G

これはRが出しているエラーメッセージで、お書きいただいた通りの意味だと
思います。データが大きすぎて扱えないということですね。

データサイズについては、FAQにも少し書いていますのでご参照下さい:
http://khc.sourceforge.net/FAQ.html#d-size

根本的な解決のためには、データがある程度以上の量になる場合、ランダムサ
ンプリングを行ってデータ量を減らすといった処理が必要だと思います。残り
のデータも分類する必要があれば、残りの1つ1つのデータについて「どのクラ
スターにそのデータが入るか」を判断するような処理を行うのが一手でしょう。

あるいは、R以外の統計ソフトを使われるのも1つの方法でしょう。


ひとまず思いつくのは以上のようなところです。


  [No.853] Re: クラスタリングエラー(推定または描画に失敗しました) 投稿者:アリ  投稿日:2011/10/03(Mon) 17:00:36

樋口先生、こんにちは。アリです。

早速、ご返事を頂き、ありがとうございます。

了解しました。

データの減らすのがちょっと厳しいので、他のツールを考えます。