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こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。
はい、お書きの通りで、各ノードの（コードブック）ベクトルをWard法で分類
しています。用意している色の数に制限があるため、クラスター数は最大12ま
でです（汗。
クラスター数の設定については、（つい先ほどスクリーンショットを公開した）
U-Matrixと相談しながら、行っていただくのが一手でしょうか。ピンクのライ
ン状に見えているところで、クラスターが分かれているかどうかといったこと
です。
http://twitpic.com/alpf4l
学習はオンラインでして、これはRのパッケージの都合です。唯一バッチ型を
実装しているclassパッケージは、ごく個人的な感触としては、少し使いにく
く感じましたので、somパッケージを使っています。これはSOM_PAKを少し扱い
やすくしたようなものかと思います。
Twitterでもつぶやいたのですが、学習にはかなり時間がかかります。70語 x
110文書で6分、70語 x 1200文書だと90分程度。テストしているノード数は
20 x 20で、これを増やすと学習時間も劇的に長くなります。
そんなこんなで、結局は「使えない」ということになるかもしれません。どう
ぞ期待せずにお待ちください。