こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。こちらこそ、有益なご示唆をいただき感謝申し上げます。Fruchterman-Reingoldの配置アルゴリズムとも相性(?)が良いのか、グループ同士が平面上で入り交じるケースが少ないようですね。今後ともどうぞよろしくお願いいたします。