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こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。
お書きいただいたのは共起ネットワークのエラーであろうかと拝察いたします。
共起ネットワークについてはigraphパッケージのバージョンが関係しまして、
少しややこしいところがあります。Rに関しては、もう少し基本的なところか
らご確認をいただければと存じます。
[段階1] まず、メニューから「ツール」「抽出語」「記述統計」「出現回数
（TF）の分布」とたどっていただき、「プロット」ボタンをクリックしてみて
ください。これでプロットが表示されれば、Rによる基本的なプロットはOKで
あることが分かります。
[段階2] 次の段階として、漱石「こころ」チュートリアルをフォローしていた
だき、p. 12の図18のような対応分析が行えるかどうかご確認ください。
「こころ」のデータはこちらです：
http://khc.sourceforge.net/kh_tuto.html
[段階3] 漱石「こころ」データで、共起ネットワーク（集計単位は「段落」）
が作成できるかどうかご確認ください。もし段階2までは上手くいったのに、
ここで詰まる場合は、Rを単独で起動し、以下のコマンドを実行して結果をお
知らせください。
> library(igraph)
> sessionInfo()
以上の[段階3]までクリアすれば、あとは必要に応じてRのパッケージをインス
トールするだけで、クラスター分析・MDS・自己組織化マップの作成を行える
はずです。