こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。私の環境で、KH Coderに付属のRだと、動いているように見えます。「edit_network1.r」でTkの画面、すなわちマウスで位置を変更できる画面が出るかと思います。この画面を消さない状態で、開いたままの状態で、「edit_network2.r」を実行していただくとどうでしょうか。