こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。
> 同じように太い線で結ばれた「語」と「語」の場合、
> 距離が近い方が、より共起の程度が強いのでしょうか?
配置の仕組み上その可能性が高いですが、あくまで可能性であり、まったく
保証されません。
あくまで、
(1) 線でつながっていれば「共起している」(共起の程度が強い)
(2) 線でつながっていなければ「共起していない」(共起の程度が弱い)
という2種類でお考えください。
> 線で結ばれず重なっている場合
語の重なりによって、線が見えていないのであれば上記(1)ですし、線がそも
そも無い場合は(2)です。
「すべての語を小さめの円で描画」オプションを使えばご確認いただけるので
はないかと思います。
すべての語を小さめの円で描画した例:
http://khc.sourceforge.net/screen_r/as_father_net_smaller.png