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こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。
どうやらKH Coderが外部プログラム（特にRとExcel）を起動できないという現
象のようです。この現象についてはごく希にご報告をいただくのですが、残念
ながら解決方法がはっきりしていません。
アンチウイルス・セキュリティ関係のソフトを一時的に無効した上で、KH Cod
erを再起動していただくと上手くいく場合があるようです。
なお、以前この現象があったPCにはVisual StudioやCygwinのような開発環境
がインストールされていたとのことですが、そういったソフトはインストール
されていますでしょうか？ またその他にも、一般的なPCには入っていなさそ
うなソフトで、インストールされているソフトがもしありましたら、お知らせ
いただけると幸甚です。もしかするとヒントになるかもしれません。
p.s.
アンチウイルス・セキュリティ関係のソフトを無効にしても上手くいかない場
合は、別のPCでお試しいただく方が早いかもしれないのですが...