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こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。

「抽出語×文脈ベクトル」表を、C:\khcoderフォルダに「vector.csv」という
名前で、保存したとします。

この場合は、Rを起動して、例えば以下のようなコマンドを実行することでク
ラスター分析を行えます。

> file <- "c:\\khcoder\\vect.csv" # ファイル名指定
> d <- read.table(file, header=T,sep=",",row.names=1) # ファイル読み込み
> h <- hclust(dist(d,method="euc") , method="ward.D2") # クラスター分析実行
> plot(h) # プロット

さらに詳しくはRのヘルプ・入門書などをご覧いただくのが良いかと存じます。
本のお薦めはこのあたりです。

入門書 http://amzn.to/1DFDGiQ
少し慣れてきたときのリファレンス http://amzn.to/1vo0Mpz

あるいは、SPSSのようなGUIのある統計ソフトを別途お使いいただくのも一手
でしょう。