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こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。
うーん、ちょっとなんとも言い難い感はございますが、「AとCには（Bを介し
た間接的な）関連がある」と書いても誤りではないように思います。
もとの文章にあたっての確認を経て、関連がありそうならば、そう書いても良
いのかな、と。
例えば、この共起ネットワークの右下、オレンジのグループを見てみましょう。
http://khc.sourceforge.net/screen_r/netg-144-sw.png
「手紙」と「読む」は、AとCのように直接つながっていませんが、言葉の意味
から考えても、関連があると見なして良さそうです。さらにもとの文章にあ
たってみると、数は多くありませんが「私は今にも変がありそうな病室を退い
てまた先生の手紙を読もうとした」といった記述もあります。こうした例なら、
「『手紙』を介して間接的なつながりがある」と書いても良いように思います。
結局は、言葉の意味や、もとの文章の様子次第ということになろうかと思いま
す。
こうした点で、共起ネットワークに限らず、図表だけを見て解釈するのではな
く、もとの文章にもあたりながら解釈されることがお勧めです。