こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。
Shift + Spaceで日本語モードにしたあと、「K」の入力前に、Shift + F9を
押してみてください。その後に「K」を入力していただくといかがでしょうか。
※FAQページの記述、少し分かりにくかったかもしれず、申し訳ありません。
それと、
> 「まだ入力は終わっていませんよ,母音のキーを押してください」の
> ような意味を表す表示
これはAtokが出している表示かどうか、お分かりになりますでしょうか。もし
分かるようでしたらお知らせいただけますと幸いです。