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こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。
TermExtractをカスタマイズするには、KH Coderをソースコードから起動する
必要があります。
kh_coder.exeと同じ場所にソースコードを解凍し、コマンドプロンプトで
「perl kh_coder.pl」を実行してKH Coderを起動するのが便利でしょう。
こうすればWindows版パッケージに同梱のMySQL・ChaSen・Rを使用できます。
ただしPerlと各種Perlモジュールだけはご自身で準備いただく必要があります。
なお、ソースコードの「kh_lib\TermExtract」フォルダ内にTermExtractの
ファイル群を置いています。