樋口様、
素晴らしいソフトの開発、公開をありがとうございます。
現在、利用させていただこうとCentOSでGnomeを入れての正常動作を確認し、マニュアルなどを読ませていただきました。

過去ログにはCUIでの操作方法を講義をされてることが記載されていましたが、CUIでの操作方法がわかりませんでした。

見落としなどがあったら申し訳ないのですが、
もしコマンド一覧などの資料があるようでしたらお教えいただけないでしょうか。
（例：たとえば　perl kh_coder.pl -beforecheck をうつと分析対象ファイルチェックが実行される等）

お忙しいかと思いますが、何卒宜しくお願い申し上げます。

失礼いたしました。
plugin_jpにサンプルコードがありましたのでそちらを参考にさせていただきます。

こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。

そうなんですコマンドライン・オプションをご自身でお作りいただけば、いろ
いろな自動処理が可能なのですが、もとから準備されたものはほとんど無いの
です。

『Rのパッケージおよびツールの作成と応用』 http://amzn.to/1w4Fe4Z
に少し解説を書きましたが、行き詰まったらここに質問をポストなさってくだ
さい。

わざわざご返信ありがとうございます。
なにかあればお言葉に甘えさせていただきたいです。

本件とは、話題がそれてしまいますが現在インストールした際に問題となった点をご報告させていただきたいと思います。

＜OS＞
CentOS7にてGnomeをインストールしたマシン
＜問題＞
Rのパッケージ、igraph1.0.1(2016/2/9最新)をインストールするとauto_runでエラーが発生した
＜対応＞
igraph_0.7での再インストール

簡単ではありますがどなたかの参考になればと思います。

こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。

そうなんです、Rのigraphパッケージは0.7以前をインストールして下さい。
最新版をインストールすると自動処理（コマンドライン・オプション）以前に、
通常の共起ネットワーク・コマンドがそもそも動かないはずです。現時点では
KH Coderは最新版のigraphに対応できていません。

※PerlとかMySQLは15年前に書いたコードがそのまま機能する（効率はともか
く動作はする）のですが、Rのパッケージ（特にigraphやggplot2）はわりとす
ぐに仕様が変わってしまって、以前のコードが動かなくなります。なかなかこ
の変化に追いつけていません。