こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。
漱石「こころ」なら大丈夫ということは、お使いのPC上で、KH Coderは正常に
機能しているようです。
この場合はデータに何らかの原因があるのかもしれません。「分析対象ファイ
ルのチェック」と自動修正の実行をお試しになると良いかもしれません。
それから、共起ネットワークのオプション画面で、「集計単位」として「段落」
を選択している場合には、データ中にある程度の数以上の「段落」があるかど
うかをご確認いただくと良いかもしれません。KH Coderで言う「段落」とは、
改行で区切られた部分です。改行がまったくないデータで、「段落」単位の集
計を行なうとエラーになる場合があるかもしれません。
現時点で思いつくのは、ひとまず以上のようなところです。