こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。

「ツール」「文書」「『文書×抽出語』表の出力」コマンドで、章をあらわす
見出しの単位（H1など）を選択して、CSVファイルを出力してください。各章
ごとの出現数が出ます。

Excel上で新しいシートに「行と列を入れ替え」て貼り付けてから、「フィル
ター」機能を使うと便利でしょう。「第1章に多い順に並べ替え」「第2章に多
い順に並べ替え」といったことを1〜2クリックで行えます。

※添付画像では「上」に多く出てくる順に、語を並べています。