樋口様

いつもお世話になっております。
たびたび申し訳ございません。

共起ネットワークの「サブグラフ検出」で描画される３種類のサブグラフは、どのような方法でグルーピングされているのでしょうか。
よろしくお願い致します。

こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。

詳しくはマニュアルのA.5.11節にお目通しいただければ幸いです。

マニュアルの記載に付け加えるとすれば、蛇足かもしれませんが、私自身は
「modularity」か「random walks」を使うことが多いです。前者では比較的
小さいグループをいくつも作る傾向があるのに対して、後者では大きなグル
ープが（少数）形成されがちでしょうか。データの特徴や、分析者が読み取
りたいと考えている事柄、解釈のしやすさなどを総合的に判断して、選んで
います。