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こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。
KH Coder 3では新規プロジェクトの作成時に、そのデータの言語をお選びいた
だくようになっています。この画面です（画面表示が英語ですが）。
http://khc.sourceforge.net/en/screen/en_cn_new_project.png
設定画面では、各言語を分析する際の設定は可能ですが、言語を選ぶことはで
きません。
※設定画面では、全プロジェクトに共通の設定を扱います。KH Coder 3では、
データの言語はプロジェクトごとに異なりうるという前提のもと、各プロジェ
クトごとにデータの言語を記憶しています。よって共通設定の画面では、言語
を選択できなくなりました。