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こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。
可能性として考えられることとしては、実際にデータ（テキストまたは外部変
数）が入力されている列の数よりも、より多くの列を読み込もうとしているの
かもしれません。または実際にデータが入力されているよりも、多くの行を読
もうとしているのかもしれません。
「新規プロジェクト」画面で当該のファイルを選択し、「分析対象とする列」
のプルダウンをクリックして、列の一覧をチェックしてみてください。実際よ
りも多くの列が表示されたり、名前が空白の列があったりしないでしょうか？
あるいは、生成されたテキストファイル（分析対象ファイル名_txt0.txt）の
末尾に、空白セルがたくさん見られないでしょうか？
この現象は「飛び地」のセルにデータが入っていたり、あるいは空白セルで
あっても書式が設定されていると発生すると思います。ご自身で確かにデータ
を入力した範囲（確かに使用するセルの範囲）以外については、選択の上「す
べてクリア」を行なっておくと良いかもしれません。
p.s.
諸事情により先程バージョンナンバーを変えないまま一部更新しました。ご面
倒ですが前回と同じ手順で「x_mac64」を上書きしていただきますと、対応分析・
多次元尺度法についても、語のクリックでKWICが開きます。