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樋口先生
ご返信ありがとうございます。
質問につきましては、ご指摘の通りマニュアルに解答がありました。
私のほうで読み落としがあったようです。大変申し訳ありません。
もう一度、マニュアル全体を精読する作業をしようと思います。
マニュアルでは以下の記述周辺を参考にさせていただきました。確認までに。
，こうした選択（※jaccardの閾値指定）の結果，描くべき共起関係がなかった語（node）については，グラフに描画されない。（p58)
特徴的な語が、必ずしも共起ネットワークの中で中心的な位置にあるわけではない、ということで、確かにその通りだと納得しました。
この度はありがとうございました。
なり