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返信して頂きありがとうございます。
>念のための確認ですが、分析対象データは日本語でしょうか。
はい、分析対象データは日本語です。
樋口先生のおっしゃる通り、miで「テキストエンコーディングエラー文字の一覧を表示」することができました。これでEUC未定義文字を全て検索することが可能になり、削除することもできるようになりました。
また、先生が示して下さった方法でCotEditorも試してみましたが、自分の環境でも同様にフリーズしてしまいました。
ですので、miを使って未定義文字を削除しようと思います。
この度は様々な解決案を示して下さり、本当にありがとうございました。
本当に助かりました。未定義文字を削除して、分析を進めて行きたいと思います。