こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。
考えられる方法は2つあります。
1つは、キーワードをダブルクォートではなく、山カッコ<>で括る方法です。
山カッコで括られた部分は、強制的に1つの語として取り出されます。
もう1つは「形態素解析の結果を再読み込み」プラグイン(マニュアルA.10.5節)
を使う方法です。※KH Coder 3では形態素解析の結果を保存したテキストファイ
ルの場所が変更になりました。前処理完了時にコンソール画面にフルパスが表示
されます。
ただし、KH Coderは半角スペースやカッコのほか「+」「-」などの記号を含む語
は想定していないので、分析や検索がエラーになることもあると思います。その
場合は、たとえば半角スペースをアンダーバーに置換するといった対策が必要に
なりそうです。
あと、品詞分解が不要ならStanford POS Taggerではなく茶筌を選んでおいた方が
前処理は早いと思います。