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早速のご回答と、改良版の公開について超迅速なご対応をまことにありがとうございます。
さっそく改良版を使用させていただきましたが、確かに表示されたJaccard係数は検算ができました。

ただし、「描画するedgeの選択」でJaccard係数を具体的な数値で指定したところ(例えば0.13)、
出力されたedgeの中にはそれより小さいJaccard係数(例えば0.09)のものも表示されています。

No.3516(以下)でもお聞きしたのですが、もしかしたらこの部分にまだ改良の余地が残っているのかと感じた次第です。

　＞　また、「描画するedgeの選択」で現状はJaccard係数≧0.3と条件づけて出力しているわけですが、この条件値も
　＞　標準化された数値と解釈します。この場合、例えば論文化する際はどのように記述することが適当と言えるでしょうか？