こんにちは、樋口です。
はい、目下の所、基本的にコーディングルールを用いてカウントできるのは文の数・段落の数・文書の数等です。
語の数にこだわられるのであれば、抽出語リストのcsvファイルを手で編集されるというのはどうでしょう?「福岡」「博多」のような目的の語がはっきりしているのであれば、それほど手間もかからないような気がします。
書き込みを拝見する限りでは、結果を使ってどういうことをしようとされているのか判然としませんので、回答が的外れになっているかもしれませんが、ひとまずのご返信までにて失礼いたします。