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はじめまして、樋口です。書き込みありがとうございます。
ご質問いただいた点の解説が、マニュアルからは抜けておりました。失
礼いたしました。
同じサブグラフに含まれるノード（語）は実線で結んでいるのに対して、
異なるサブグラフに含まれるノードは破線で結んでいます。それだけ
のことですので、深遠な意味があるわけではなく、単にグラフ（ネット
ワーク図）を見やすくするための小さな工夫です。
なお、こうしたことから、「サブグラフ検出」を行っていないグラフで
は、すべて実線となります。