ご返信ありがとうございます。
JGR導入前にはLinux環境下でも正常に動いており、Windows環境下でも同エラーの再現なく通常通り稼働しています。(尚、KH Coderの再インストールも試してみましたが同様の結果です)
これまで共起ネットワークを分析に使う事が多く、R形式で保存してGUI上でカスタマイズを考えていたのでJGRを入れてみたのですが、その後共起ネットワークが描画出来ず、他の分析ツールでもエラーが出てLinux環境に起因した描画エラーかなと考えています。
Windows環境下で正式稼働したデータを用いて、Rでの描画が伴う下記4つを試した際のエラーアラートに表示されるメッセージです。
対応分析エラー時のアラート
Note:polygon geometry computations in maptools
depend on the package gpclib, which has a restricted licence. It is disabled by default;
to enable gpclib, type gpclibPermit()
Checking rgeos availability as gpclib substitute:FALSE
多次元尺度構成法エラー時のアラート
initial value 38.651060
iter 5value 32.814336
iter 10value 28.180384
iter 15value 26.982192
iter 15value 26.963666
iter 15value 26.962424
final value 26.962424
converged
階層的クラスター分析エラー時のアラート
(アラートメッセージが空欄で複数回続いた後、先のCan't call method "rotate_cls"...のエラー表示)
共起ネットワーク分析エラー時のアラート
(アラートメッセージは空欄で複数回続いた後、先のCan't use string...のエラー表示)
ヒントになれば良いのですが…。
よろしくお願いいたします。