こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。

当方の環境ではエラーが出ずに、正常に処理されるようでして、原因がつかめ
ずにおります。

Rは、「Rgui.bat」をダブルクリックして、KH Coderに付属のバージョンをお
使いでしょうか？　R起動時のコンソールの1行目にRのバージョンが表示され
ていると思いますが、バージョンナンバーや日付はどのようになっていますで
しょうか？

また、一度Rを終了してクリーンな状態で起動し、対応分析とコマンド実行を
行うとどうでしょうか？

それでもだめな場合は、
> if (biplot){
という箇所を、
> if (biplot==1){
に変更するといかがでしょうか。