こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。
また、詳細に状況をお知らせいただき、大変助かります。

さて、共起ネットワークでは、他の語とつながっていない孤立した語、すなわ
ちedgeを持たない語は表示されません。これは、語と語のつながり（edge）に
注目しようという考え方によるものです。

したがって描画するedgeの数を増やすと、表示される語も多くなる可能性があ
ります。

なお「調整」ボタンの右の部分にマウスカーソルを置いてしばらく待ちますと、
添付画像のように情報が表示されます。添付画像の場合には69語のうち37語だ
けが表示されていることがわかります。また、極めて弱いものも含めれば2311
のつながりがあった中で、上位60を表示しています。その結果として、Jaccard
計数が.138以上のつながりを表示することになっています。
ここで言う「つながり」＝edge(s)、「語」＝node(s)です。