Re: 共起ネットワークでMSTのみ描画について (袋井) KH Coder 旧掲示板
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  [No.953] 共起ネットワークでMSTのみ描画について 投稿者:袋井  投稿日:2012/05/10(Thu) 20:42:44

樋口先生様;

お世話になります、袋井と申します。

毎々、マニアックな質問でご迷惑をお掛けしております。


MST(最小スパン木)機能により重要なつながりが強調表示されますが、見易さを高めるためにMSTのみを描画したいと思います。

MST以外のエッジを非表示にするなどの技法もあるかと思いますが、知識が乏しいためにできません。

ノードのレイアウトが変わってしまうかもしれませんが、以下の手順・手続きでもよいのか、ご確認をさせてください。
よろしくお願いします。

−−−
Rファイルを保存

保存したRファイルを実行

グラフが描画された後に、以下のコマンドを実行

# MSTの検出
mst <- minimum.spanning.tree(
n2,
weights = 1 - get.edge.attribute(n2, "weight"),
algorithm="prim"
)

# n2オブジェクトへコピー
n2 <- mst


以降、保存したRファイルのn2描画コードをコピー&ペーストして実行

−−−

それらしいグラフが表示されますが、ご確認させてください。

よろしくお願いします。


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