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こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。
> 現時点のやり方では、
> 「ツール」→「抽出後」→「関連語検索」
> で、コーディングルール・ファイルに上記のtxtファイルを読み込ませて、
> どれかの概念を選択し(本来は複数選択したいのですが・・・)、
> 「共起ネット」をクリックして作成しています。
複数選択できれば良いということでしたら、Ctrlキーを押しながらコード（概
念）をクリックすることで、複数選択可能です。デフォルトではコードの
「AND検索」となりますので、「OR検索」を選択し、「集計」「共起ネット」
をクリックしてください。
ただこの方法ですと、コード（概念）が語に分解？された形で、共起ネット
ワークが描かれます。この分解？を行わずに、コード（概念）と語の共起
ネットワークを作成されたいということでしょうか。