はじめまして。
初めてKH coderを使わせていただいております。試行錯誤の日々です。
KH coderとCytoscapeの連携についての過去ログを読んで，やってみたいと思いました。
Rで共起ネットワークを読み込むのはできましたが，そこからCytoscape向けに保存する方法が分からずに前に進めません…。
もしできれば方法を教えてくださると幸いです。

こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。

おそらく、こちらのスレッドをご覧いただいたのかなと思います。
http://khcoder.info/cgi-bin/bbs_khn/khcf.cgi?no=577&mode=allread

具体的に「この記述が分かりにくい」「この記述を実行したが、
ファイルが作成されない」など、ありますでしょうか？

返信ありがとうございます。


そのスレッドを見てやってみようとしたのですが

スレッドの文中の手順についての記述の中に
「(2) Rを起動して、(1)で保存したファイルを読みこみ、Cytoscape向けにデータを保存」と書いてあります。

でも，どうやればCytoscape向けにデータを保存できるのかが分からなかったです。((1)で保存したデータを読み込むのはできました)

例えばここをクリックすればいい…等の手順を教えてほしいです。

こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。

その投稿を、もう少し下まで読み進めていただきますと、

> そしてRのメニューから「ファイル」→「ディレクトリの選択」をクリックし

から始まる段落があります。この段落の内容をまずはご参照ください。

ありがとうございます。
もう少し頑張ってみます。

こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。
念のために少し捕捉です。

> (2) Rを起動して、(1)で保存したファイルを読みこみ、Cytoscape向けにデータを保存

と書いてありまして、そのためにはどこをクリックしてどうするのかという詳
細が、その後の段落に書いてあります。

「Rを起動して、(1)で保存したファイルを読みこ」む詳細な手順については、
以下の記述で始まる段落です。

> (2)についての補足として、KH Coderに添付のRは、

そして「Cytoscape向けにデータを保存」する詳細な手順については、以下の
記述で始まる段落です。

> そしてRのメニューから「ファイル」→「ディレクトリの選択」をクリック