こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。添付のIPADicを使う場合、どちらでもそれほど大差ないと思います。ただ、MeCab用にしか公開されていない辞書を使いたい場合にはMeCabを使うしかないですね。例えば、UniDic、近代文語UniDic、中古和文UniDic等です。