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こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。
「抽出語検索」の画面で「向」を検索してみて下さい。「むこうへ行く」の
「向う（むこう・名詞）」と、「そちらへむかう」の「向う（むかう・動
詞）」の2種類があることが分かります。
これら2つが、どちらもプロットにあらわれているという現象です。KH Coder
は、品詞が違えば別の語として扱います。
スクリーンショットのRは、おそらく、KH Coderに添付のRとはバージョンが
異なるものかと存じます。お使いのバージョンでは、列名に同じ名前が
使われるのを避けるために、「.1」が付与されているのかなと思います。
以上、ご参考にしていただける部分がございましたら幸いです。