Re: 共起ネットワークでMSTのみ描画について (HIGUCHI Koichi) KH Coder 旧掲示板
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  [No.954] Re: 共起ネットワークでMSTのみ描画について 投稿者:HIGUCHI Koichi  投稿日:2012/05/10(Thu) 22:32:41

こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。

はい、お書きいただいた内容で間違いないと思います。

MSTを表示しない設定で共起ネットワークを作成し、「R-Source」形式で保存
し、お書きいただいたコマンドを「# 初期配置」という行の直前に挿入してい
ただいても良いでしょう。

Edgeの数が60以下のシンプルなネットワークで、KH Coder上でのMST表示と、
MSTのみにしたものを比較していただくと、成功していることがはっきりしよ
うかと思います。

> MST以外のエッジを非表示に

これもおもしろそうですが、MSTのみを表示するのであれば、MSTのみでレイア
ウトをやり直したほうが見やすい表示になるでしょう。すなわち現在なさって
いるやり方が良いかと思います。


とは言いつつ、もしご自身でお試しになる場合は、まずMSTを表示する設定で
共起ネットワークを作成し、「R-Source」形式で保存します。

そして、「# MSTに合致するedgeを強調」という行を検索し、直後に、以下の行
を挿入します。
> edg_lty <- rep(0, ecount(n2) )

例によって最初の「>」は無視して、それ移行を挿入して下さい。

上書き保存をしてRで実行すれば、レイアウトを変えずに、MST以外のエッジが
非表示になります。(それほど見やすくないかもしれないと思いますが…)

以上、ご参考にしていただける部分がありましたら幸いです。


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