こんにちは、樋口です。書き込みありがとうございます。
> ただし、「描画するedgeの選択」でJaccard係数を具体的な数値で指定した
> ところ(例えば0.13)、出力されたedgeの中にはそれより小さいJaccard係数
> (例えば0.09)のものも表示されています。
共起関係(線)を描画するかどうかの選択には調整済みの係数を用い、一方
で画面表示は調整なしの係数ですので、どうしても両者にはずれが生じます。
この部分はちょっといかんしともしがたいかもしれません。
もし、改善のアイデア等ございましたらお教え下さい。