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樋口さんにメールで相談したところ，私のデータの作り方に問題があったことが判明しました。
具体的には，<h2>タグを見出しを囲むのではなくて，記事全文を囲むのに使っていた，というボケな理由でした。
お騒がせしました。
> > そしたら，前処理データの整合性が失われました。
> > h2, bun-bunr2
>
> ひとまず、「</H2>」が抜けている箇所、すなわち閉じられていない
> H2見出しが無いかどうかをご確認いただけますでしょうか。
>
> それが見あたらない場合、PCを再起動した上でもう一度前処理を
> 行ってみていただけますでしょうか。
>
> それでも同じエラーが出るとなると、、、ちょっと対策を検討しま
> すので、とりあえずは上記をお試し下さい。