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樋口先生
やっぱり私のPCソフトの何かが原因っぽい感じです。
共起ネットワークや出現回数の分布をプロットしようとしたところ、
Statistics::R::Bridge::pipe::read_processR, Sleep and Retry!や
Statistics::R::Bridge::pipe::send, signal from read_processRのように表示され、Rのバージョンを下げたりしてみたのですが、ダメでした。
過去の掲示板を見ても、私と同じような症状の場合は大抵ウイルスソフトが原因だった場合が多かったのでおそらくそうなのでしょう。
長い時間ご丁寧に対応していただきありがとうございました。
とりあえずは、Mac KH Coderは一時寝かせておいて、BootCampにWindowsを導入するなどして使おうと思います。
大変お手数をお掛けして申し訳ありませんでした。